В первую очередь надо учитывать, что биопрепараты активизируются при температуре от четырёх градусов тепла, поэтому в зимнее время их эффективность под вопросом.

Обязательным условием для того, чтобы средство для выгребных ям работало эффективно можно считать достаточное количество жидкости - уровень воды должен быть минимум на два сантиметра выше твердых отходов, иногда уровень воды приходится контролировать еще пару дней после добавления в яму препарата.  Также нельзя допускать простоя сливной системы более двух недель, поскольку без поступления в канализацию отходов, микроорганизмы становятся малоактивными или совсем погибают.

Биоактиваторы подразделяются на 2 вида: аэробные и анаэробные. Первые работают благодаря контакту с кислородом. Чтобы обеспечить его доступ, септик должен быть оборудован компрессором. Применение препаратов такого рода удобнее, поскольку они образуют меньший осадок твердых отходов, качественнее очищают жидкость, не требуя чистки при помощи ассенизаторов. Переработанные аэробными препаратами вещества могут применяться как удобрения.

Вторые применяются без доступа воздуха. Работают они таким образом, что твердые вещества, оседая на дно, сгнивают, а жидкость очищается и осветляется. Твердый осадок необходимо удалять специальным оборудованием. Для компоста твёрдые вещества прошедшие обработку анаэробными препаратами применяться не могут.